目的：肠道微生物组的改变与系统性红斑狼疮 (SLE) 的发病机制有关。然而，关于SLE肠道微生物组及其与宿主相互作用的全面视图仍有待揭示。本研究旨在通过全面的宏基因组范围关联研究 (MWAS) 以及相应的综合分析，揭示肠道微生物群与SLE 相关的变化及其与宿主的相互作用。

     方法：全宏基因组鸟枪法测序技术与常规16S核糖体RNA测序相比有很多优势，例如更高的分类分辨率和适用于功能分析。研究者基于日本群体（N病例 = 47，N对照 = 203）肠道微生物DNA的鸟枪测序对SLE进行了MWAS。研究者将MWAS的结果与全基因组关联研究 (GWAS) 数据和血浆代谢物数据相结合。

     结果: 通过物种水平的系统发育分析，该研究确定并验证了SLE患者中间链球菌和心绞痛链球菌的增加。微生物基因分析显示链球菌衍生基因增加，包括参与氧化还原反应的基因。此外，与硫代谢和鞭毛组装相关的微生物途径在SLE患者中发生了改变。研究者通过比较MWAS和SLE的GWAS（即 MWAS-GWAS 相互作用）结果，确定了宏基因组和种系基因组之间丰富的生物学途径的重叠。α-多样性和β-多样性分析提供了SLE患者宏基因组生态失调的证据。微生物组-代谢组关联分析确定了酰基肉碱与中间链球菌（一种SLE相关分类群）的剂量正相关。

     结论：该研究的MWAS以及随后的综合分析揭示了SLE相关的肠道微生物组变化及其与宿主的相互作用，这有助于我们了解微生物组与SLE之间的关系。

出处：

Tomofuji Y, Maeda Y, Oguro-Igashira E, et al. Metagenome-wide association study revealed disease-specific landscape of the gut microbiome of systemic lupus erythematosus in Japanese. Annals of the Rheumatic Diseases 2021;80:1575-1583.