肾透明细胞癌（ccRCC）作为肾癌的主要亚型，因其治疗抵抗性和高复发率一直是医学研究的热点和难点。鉴于对传统放化疗的不敏感性，靶向治疗和免疫疗法成为治疗ccRCC的主要手段。然而，ccRCC的高度异质性和复杂的肿瘤微环境（TME）对治疗效果构成了挑战。

电子科技大学的Yuan Zhang教授团队联合福建医科大学第二附属医院的QingLiu He教授团队在本刊上发表了题为“Integrated bulk and single-cell transcriptome data identify clinically relevant cell populations in clear cell renal cell carcinoma”的研究快讯。这项研究通过整合单细胞和批量转录组数据，鉴定出了ccRCC中具有临床相关性的细胞群体，为个性化治疗策略的指定提供了新的分子标志物。

1. 肿瘤细胞亚群的分子特征

研究团队利用单细胞RNA测序技术在ccRCC组织中识别出包括癌细胞、巨噬细胞、T细胞等在内的7种主要细胞类型（图1A）。进一步通过亚群聚类分析，研究团队识别出2个癌细胞亚群C1和C2，它们分别与氧化磷酸化基因表达降低和干扰素-γ反应相关的基因表达水平升高相关（图1B、C），这两个亚群可能用于预测患者的预后。

2. 与肿瘤转移相关的细胞群体

研究揭示了T细胞和巨噬细胞可能与ccRCC的转移有关。通过比较原位肿瘤和发生远处转移的肿瘤组织的基因表达差异，研究团队发现与转移相关的基因在循环T细胞、T细胞和巨噬细胞标志物基因中显著富集。此外，这些细胞类型中的免疫检查点蛋白和促炎基因表达水平较高，提示它们可能在肿瘤免疫逃逸中发挥作用（图1 D–F）。

3. 与治疗反应相关的细胞类型

研究还探讨了与索拉非尼和抗PD-1治疗反应相关的细胞类型。结果显示，与索拉非尼敏感性相关的基因在癌细胞中表达，且这些基因参与了糖酵解过程，提示肿瘤细胞的代谢重编程可能与索拉非尼治疗的敏感性相关。而与抗PD-1治疗抵抗性相关的基因则在癌细胞的标志物基因中富集，表明癌细胞可能通过抑制T细胞激活来减弱对免疫疗法的反应（图1 G、H）。

图1. 使用批量和单细胞基因表达数据来确定与预后、转移和治疗反应相关的细胞类型。

这项研究不仅为理解ccRCC的分子机制提供了新的视角，而且通过识别与预后、转移和治疗反应相关的细胞群体，为开发新的治疗策略提供了支持。研究结果强调了单细胞转录组测序在揭示肿瘤异质性中的重要性，并为未来的精准医疗和个性化治疗提供了重要的分子生物学基础。通过这些发现，我们有望更好地预测治疗效果，为患者提供更个性化的治疗方案。

文章来源

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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352304223001204

引用这篇文章：

Zhang P, Zhang P, Gao J, et al. Integrated bulk and single-cell transcriptome data identify clinically relevant cell populations in clear cell renal cell carcinoma. Genes Dis. 2024;11(1):42-45.